以深度學習模型預測蛋白質構象變體 —— Discovery Studio Simulation 助力藥物研發

蛋白質結構具有高度動態性,準確預測多種構象對於理解其生物功能至關重要。 深度學習模型(如 AlphaFold 和 OpenFold)已經顛覆了結構生物學的發展,但我們如何進一步發掘其潛能?

本次重播將介紹一種全新的多重序列比對(MSA)子抽樣策略。該策略利用直接耦合分析(DCA)來形成進化相關序列的群集,從而引導 AlphaFold 等模型偏向不同的構象狀態。我們還將展示該方法如何在 Discovery Studio Simulation 中實施與應用,並與已知的功能性構象進行對比分析,探索其在多種生物系統中的應用潛力。

 

Webinar 重點內容:

  • 探索 Discovery Studio Simulation 的全新蛋白質構象搜索(Protein Conformation Search)技術
  • 了解 AlphaFold2 如何預測蛋白質的多種構象
  • 發掘 AlphaFold2 與分子動力學模擬(MD Simulation)的協同優勢
  • 觀察蛋白質構象搜索如何應用於變構蛋白(Metamorphic Proteins)

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